Vérâtre noir est très toxique, toutes les parties de la plante contenant des composés toxiques. La concentration la plus élevée se trouve dans le rhizome. L'ingestion de seulement 0,6 g de vérâtre noir a déjà entraîné la mort. En cas d'ingestion, une irritation des muqueuses, des vomissements et des diarrhées sont probables. Un ralentissement du rythme cardiaque, une baisse de la tension artérielle, des maux de tête et des étourdissements, une confusion, une vision floue et une transpiration excessive sont également des effets secondaires courants de l'ingestion. Dans les cas les plus graves, elle peut entraîner des anomalies cardiaques, des crampes et des contractions musculaires, des douleurs aiguës dans tout le corps, des crises d'épilepsie, une faiblesse, une perte de conscience et la mort. En cas d'inhalation par le nez, l'irritation de la peau provoque des éternuements et de la toux. Il peut également provoquer une dermatite de contact en cas d'application topique.