Alfavaca-de-cobra pode causar uma reação alérgica em pessoas que são sensíveis ao seu pólen. As pessoas podem ser expostas ao pólen pelo ar se estiver próximo ou ao manusear a planta. Os sintomas de uma reação alérgica podem ser moderados a fatais e podem incluir coceira na garganta e nos ouvidos, tosse, espirros, coriza, nariz entupido, coceira, olhos lacrimejantes, dificuldade para respirar e falar, ataque de asma, pressão arterial baixa e anafilático choque. O pólen também pode causar eczema ou urticária se entrar em contato com a pele de um indivíduo alérgico. O clima seco e ventoso pode aumentar a probabilidade de exposição ao pólen em áreas onde alfavaca-de-cobra cresce.