Все части бобовник анагировидный очень токсичны из-за содержания вредного алкалоида цитизина. Семена особенно опасны, поскольку они содержат самую высокую концентрацию этого токсичного компонента, хотя данные свидетельствуют о том, что они не причиняют серьезного вреда, если проглатывается лишь небольшое количество семян. Некоторые люди могут испытывать желудочно-кишечные расстройства, такие как тошнота, рвота и диарея. Если бобовник анагировидный употребляется в больших количествах, это может привести к более серьезным последствиям, таким как пена во рту, сильная сонливость, нервозность, боли в кишечнике, нерегулярный пульс, судороги, кому и даже летальный исход. Нет никаких доказательств того, что бобовник анагировидный вызывает дерматит при прямом контакте с кожей.